Генетика и молекулярная биология

Генетический форум
Текущее время: Ср сен 20, 2017 8:33 pm

Часовой пояс: UTC + 4 часа




Начать новую тему Ответить на тему  [ 1 сообщение ] 
Автор Сообщение
СообщениеДобавлено: Чт апр 09, 2015 9:36 am 
Не в сети
Новичок
Новичок

Зарегистрирован: Чт ноя 27, 2014 8:02 am
Сообщения: 3
МАТЕМАТИЧЕСКАЯ ФОРМУЛА ДНК
( систематизация результатов Human Genome Project, HGP )

Систематизация результатов проекта "Геном человека" предполагает использование математических инструментов. С помощью этих инструментов составляется математическая формула ДНК

Математическая формула ДНК ( Mathematical formula of DNA ) имеет 2 вида -

1 ВИД
Математической формулы ДНК ( построенная по дедукции - от общего к частному) -
100X333X333X333=3 300 000 000

где-
1)
100=стандартное множество пар нуклеотидов-
C С
C C C T G A C T G A C T
C C G A C C G G A G A G
G C T G G G G T T T C A
G T C A G T C T T T T T
A A A C A G A A T C A А
T G G C T A A C G C C T
T C C G G T G C A G T A
A T T C A T A A G T A A
А А.

2)
333 = 8,6,1,8, 1,1,6,1,6,1,8,1,1,6,6,1,1,8,1,15,8,8,
8,15,8,8,8,15,8,8,8,7,8,7,1,1,7,7,8,7,1,7,1,
1,7,7,7,8,1,7,8,7,1,7,7.7,1,7 - множество элементов, представляющих количество электронов в атомах модели мономера,

3)
3 300 000 000= 3 300 000 000 пар нуклеотидов,

.
2 ВИД
Математической Формулы ДНК( построенная по индукции - от частного к общему) -

8AAA,6АAA,1АAA,8АAA, 1АAA,1АAA,6АAA,1АAA,6АAA,1АAA,8АAA,1АAA,1АAA,6АAA,6АAA,1АAA,1АAA,8АAA,1АAA,15АAA,8АAA,8АAA,
8АAA,15АAA,8АAA,8АAA,8АAA,15АAA,8АAA,8АAA,8АAA,7АAA,8АAA,7АAA,1АAA,1АAA,7АAA,7АAA,8АAA,7АAA,1АAA,7АAA,1АAA,
1АAA,7АAA,7АAA,7АAA,8АAA,1АAA,7АAA,8АAA,7АAA,1АAA,7АAA,7АAA.7АAA,1АAA,7АAA

где
1А= стандартное множество триплетов -
C,С,
C C C, T G A, C T G, A C T,
C C G, A C C, G G A, G A G,
G C T, G G G, G T T, T C A,
G T C, A G T, C T T, T T T,
A A A, C A G, A A T, C A A,
T G G, C T A, A C G, C C T,
T C C, G G T, G C A, G T A,
A T T, C A T, A A G, T A A,
А, А.

Стандартное множество триплетов состоит из 32 триплетов и 4 пар нуклеотидов.( С,С, А, А) .
В сумме =100 пар нуклеотидов ( смотрите примечание №1)

Данная формула может рассматриваться как интерпретация результатов проекта "/Геном человека" ( Human Genome Project, HGP ) . Также она может повысить эффективность методов секвенирования нового поколения (next-generation sequencing methods ).

.
Составление математической формулы ДНК предполагает осуществления 4 методологических операций-
1) определение математической модели мономера ДНК,
2) определение 4 типов последовательностей нуклеотидов, представленных азотистыми основаниями,
3) определение стандартного множества триплетов, а также стандартного множества пар нуклеотидов.
4) определение Математической Формулы ДНК, в которой минимальным элементом является стандартное множество триплетов, или стандартное множество пар нуклеотидов.

1 ОПЕРАЦИЯ - ОПРЕДЕЛЕНИЕ МАТЕМАТИЧЕСКОЙ МОДЕЛИ МОНОМЕРА ДНК -

1 ДЕЙСТВИЕ -

1 ШАГ-
определение обьекта исследования.
Таким обьектом исследования является химическая формула
дезоксирибонуклеотида ( смотрите примечание №2)

2 ШАГ-
выбор метода исследования, Этим методом является абстрагирование ( отвлечение) от -
а)протонов
б) нейтронов,
в)типов химических связей ( ионной, ковалентной, водородной),
г) электронных оболочек атомов.

В рамках такого метода рассматриваются только электроны в их количественном соотношении.
При этом каждый электрон представлен в геометрическом виде ( в виде куба в трёхмерном измерении, в двухмерном измерении представленным как квадрат).

В результате исследования составляется математическая модель мономера ДНК.
Математическая модель мономера ДНК представляет правильную геометрическую конструкцию на 97% аналогичной кубу
( Смотрите графики к тексту
https://www.facebook.com/groups/1482355712029705/ )

Математическая модель мономера соответствует химической формуле дезоксирибонуклеотида за одним исключением,
Порядок следования в пентозе начинается не с первого по порядку следования кислорода -1О, а с первого по порядку следования углерода -1С..

Математическая модель мономера ДНК в числовом выражении имеет следующий вид -
8,6,1,8, 1,1,6,1,6,1,8,1,1,6,6,1,1,8,1,15,8,8,
8,15,8,8,8,15,8,8,8,7,8,7,1,1,7,7,8,7,1,7,1,
1,7,7,7,8,1,7,8,7,1,7,7.7,1,7
Это множество элементов, представляющих количество электронов в последовательности атомов математической модели мономера.
В сумме 333 электрона.
Обозначим это множество символом 1.

Математическая модель мономера ДНК позволяет открыть
ЛОГИКУ ДНК, а также другие важные свойства двойной спирали.

Мономер ДНК, а следовательно и вся двойная спираль в математическом аспекте обладают -
1) алгоритмом, которым является число 19.
( смотрите примечание №3 и № 4; )

2) симметричностью на различных уровнях- на уровне дезоксирибозы, азотистых оснований, остатков фосфорной кислоты, а также в целом
Мономер ДНК является правильной геометрической конструкцией на 97% аналогичной кубу. Это правильная -симметричная конструкция и наиболее простая из всех 6 правильных многоугольников. Куб представляет идеальную геометрическую форму. Таким образом, мономер ДНК и вся двойная спираль, в аспекте математики, приближаются ( на 97% ) к идеальной геометрической форме. Данное приближение к математическому идеалу выражает ЛОГИКУ ДНК
( Смотрите графики к тексту
https://www.facebook.com/groups/1482355712029705/ )

3) непрерывностью компонентов мономера на атомарном и электронном уровнях. Данное обстоятельство свидетельствует о недискретном ( континуальном ) характере связей между компонентами мономера..
( смотрите примечание №5)

4) соотношением с 20 каноническими аминокислотами
( 19 аминокислот и 1 иминокислота - пролин). Соотношение по количеству электронов в множестве азотистых оснований и одной из аминокислот, по убыванию, которое уменьшает до минимума разницу между ними.

2 ОПЕРАЦИЯ - ОПРЕДЕЛЕНИЕ 4 ТИПОВ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ НУКЛЕОТИДОВ, ПРЕДСТАВЛЕННЫХ АЗОТИСТЫМИ ОСНОВАНИЯМИ.

1 ДЕЙСТВИЕ -
операция расширения модели мономера, в результате чего составляется множество мономеров (смотрите примечание № 6 )

2 ДЕЙСТВИЕ -
выделение числа 55.

1 ШАГ -
рассмотрение дезоксирибозы, азотистых оснований и аминогруппы с точки зрения количества электронов, которые содержаться в них .

Пункт 1
Дезоксирибоза, рассматриваемая индивидуально, то есть в отдельно от мономера состоит из - 10 электронов 10 атомов водорода, 30 электронов 5 атомов углерода, 32 электронов 4 атомов кислорода. В сумме получается 72 электрона ( смотрите примечание №7)

Пункт 2
Азотистые основания в сумме имеют 145 электронов.

Пункт 3
Аминогруппа состоит из 1N и 2H. В сумме они дают 9 электронов.( смотрите примечание № 8)

.
2 ШАГ -
9 электронов, то есть 7 электронов атома азота гуанина и 1 электрон атома водорода гуанина, а также 1 электрон атома водорода тимина вычитаются из азотистых оснований.
В результате в азотистых основаниях остаётся 136 электронов.

3 ШАГ -
9 электронов, то есть 7 электронов атома азота гуанина и 1 электрон атома водорода гуанина, а также 1 электрон атома водорода тимина прибавляются дезоксирибозе (72 электрона ).
В результате получается 81 электрон.

4 ШАГ -
определяется разница в количестве электронов между дезоксирибозой(72 электрона) вместе с присоединёнными 9 электронами ( в сумме дающими 81 электрон) и остатками азотистых оснований (136 электронов).
Разница составляет 55 электронов.

3 ДЕЙСТВИЕ-
деление остатков азотистых оснований на 2 части -
Первая часть представляет 2 азотистых основания - гуанин ( G) и цитозин (C). Поэтому их связка обозначается как GC, или как CG.
Вторая часть представляет 2 азотистые основания - аденин (А) и тимин (Т). Поэтому их связка обозначается как АТ, или как ТА.
В целом множество азотистых оснований обозначим как множество АТ,GC

4 ДЕЙСТВИЕ -
упорядочивание множества из 20 канонических аминокислот, являющимися обычными компонентами белка.. Это упорядочивание осуществляется по следующим признакам-
1. по количеству электронов во всех атомах аминокислоты.
2. по количеству атомов.
3. по наличию или отсутствию ароматического кольца .
4. по наличию, или отсутствию симметрии.в химической формуле аминокислоты

В результате упорядочивания строится следующая последовательность из аминокислот-
пролин, аргинин,лизин,метионин,глутамин, глутаминовая кислота,
изолейцин, лейцин,аспарагин, аспарагиновая кислота,валин,треонин, цистеин,гистидин,тирозин,серин,триптофан,аланин,фенилаланин,глицин

5 ДЕЙСТВИЕ -
последовательное вычитание электронов из азотистых оснований.
Эта операция вычитания требует выполнения следующих шагов-

1ШАГ-
Каждая аминокислота рассматривается по количеству электронов-

пролин 56

аргинин 55

лизин 41

метионин 41

глутамин 39

глутам. кисл 39

изолейцин 37

лейцин 37

аспарагин 31

аспар. кисл. 31

валин 25

треоин 25

цистеин 25

гистидин 23

тирозин 17

серин 17

триптофан 16

аланин 9

фенилаланин 8

глицин 1

2 ШАГ -
определение разницы в количестве электронов аминокислоты и числом 55

аминокислота количество электронов разница
пролин 56 +1

аргинин 55 0

лизин 41 14

метионин 41 14

глутамин 39 16

глутам. кисл 39 16

изолейцин 37 18

лейцин 37 18

аспарагин 31 24

аспар. кисл. 31 24

валин 25 30

треоин 25 30

цистеин 25 30

гистидин 23 32

тирозин 17 38

серин 17 38

триптофан 16 39

аланин 9 46

фенилаланин 8 47

глицин 1 54

3 ШАГ-
вычитание полученной разницы из одной из двух групп азотистых оснований ( или из АТ , или из GC)

аминокислота кол-во электронов разница основание

пролин 56 +1 C

аргинин 55 0 C

лизин 41 14 C

метионин 41 14 Т

глутамин 39 16 G

глутам. кисл 39 16 А

изолейцин 37 18 C

лейцин 37 18 Т

аспарагин 31 24 G

аспар. кисл. 31 24 А

валин 25 30 C

треоин 25 30 Т

цистеин 25 30 C

гистидин 23 32 C

тирозин 17 38 G

серин 17 38 A

триптофан 16 39 C

аланин 9 46 C

фенилаланин 8 47 C

глицин 1 54 C

4 ШАГ-
азотистой основание , из которого вычитается наибольшее количество электронов будет первым в группе азотистых оснований ( или AT ,или TA, а также или GC , или CG)

разница между дезоксирибозой (72 электрона ) вместе с 9 электронами, дающими в сумме 81 электрон и остатком азотистых оснований ( 136 электронов) составляет 55 электронов.

В результате составляется следующая таблица-

аминокислота кол-во электронов разница основание1 основание 2
пролин 56 +1 C CGTA

аргинин 55 0 C CGTA

лизин 41 14 C CGTA

метионин 41 14 T TACG

глутамин 39 16 G GCAT

глутам. кисл 39 16 A ATGC

изолейцин 37 18 C CGTA

лейцин 37 18 T TACG

аспарагин 31 24 G GCAT

аспар. кисл. 31 24 A ATGC

валин 25 30 C CGTA

треоин 25 30 T TACG

цистеин 25 30 C CGTA

гистидин 23 32 C CGTA

тирозин 17 38 G GCAT

серин 17 38 A ATGC

триптофан 16 39 C CGTA

аланин 9 46 C CGTA

фенилаланин 8 47 C CGTA

глицин 1 54 C CGTA

( основание 1 это азотистые основания из которых вычитается разница , основание 2 это азотистые основания, которые получились в результате вычитания )

7 ДЕЙСТВИЕ -

1 ШАГ-
Выделяется первые элементы , а также вторые элементы спаренных нуклеотидов.

C C C T G A C T G A C T C C G A C C C C
обозначим это множества символом а,

2 ШАГ-
выделяются вторые и первые элементы спаренных нуклеотидов-

G G G A C T G A C T G A G G C T G G G G
обозначим это множество символом в,

3 ШАГ-
выделяются первые и вторые элементы спаренных нуклеотидов-

T T T C A G T C A G T C T T A G T T T T
обозначим это множество символом с,

4 ШАГ-
выделяются вторые и первые элементы спаренных нуклеотидов-

A A A G T C A G T C A G A A T C A A A A
обозначим это множество символом d,,

Множества a,b,c,d являются 4 типами вариаций нуклеотидов.

5 ШАГ-
к множеству a прибавляются два дополнительных элемента - С,С.
Так как на первом и втором шаге - для пролина и аргинина не обеспечивается операция вычитания для разницы числа 55.Поэтому первый и второй нуклеотиды ( С и С) выделяются от других элементов, Их выделение осуществляется за счёт их удвоения, то есть С, С и С,С

С С
C C C T G A C T G A C T C C G A C C C C

6 ШАГ-
Суммирование 4 множеств. В множествах a, b, с, d содержатся 80 пар нуклеотидов, а также 2 дополнительные пары нуклеотидов - С.С
В целом множество имеет 82 пары нуклеотидов-
С С
C C C T G A C T G A C T C C G A C C C C
G G G A C T G A C T G A G G C T G G G G
T T T C A G T C A G T C T T A G T T T T
A A A G T C A G T C A G A A T C A A A A

3 ОПЕРАЦИЯ - ОПРЕДЕЛЕНИЕ СТАНДАРТНОГО МНОЖЕСТВА ТРИПЛЕТОВ А ТАКЖЕ СТАНДАРТНОГО МНОЖЕСТВА ПАР НУКЛЕОТИДОВ-

1 ДЕЙСТВИЕ-
формирование стандартного множества триплетов-

1 ШАГ-
группирование формирование триплетов - по.3 пары последовательных нуклеотидов-
С ,С,
C C C, T G A, C T G, A C T, C C G, A C C,
C CG, G G A, C T G, A C T, G A G, G C T,
G G G, G T T, T C A, G T C, A G T, C T T,
A G T, T T T, A A A, G T C, A G T, C A G,
A A T, C A A,
A ,A,. ( А,А и С,С - остаток из 4 пар нуклеотидов)
( смотрите примечание № 9 )

2 ШАГ-
выделение не повторяющихся триплтетов -
С,С,
C C C, T G A, C T G, A C T,
C C G, A C C, G G A, G A G,
G C T, G G G, G T T, T C A,
G T C, A G T, C T T, T T T,
A A A, C A G, A A T, C A A,
A ,A, .
20 не повторяющихся триплетов,
то есть 20 основных триплетов+ А,А,С,С (остаток).

3 ШАГ-
выделение 12 триплетов - не палиндромных, а также не асимметричных пар-
T G A, C T G, A C T,
C C G, A C C, G G A,
G C T, G T T, C T T,
C A G, A A T, C A A

4 ШАГ-
дополнение к каждому из 12 не асимметричных и непалиндромных триплетов-

T G A, =T G G
C T G, = C T A
A C T, = A C G
C C G, = C C T
A C C, = T C C
G G A,= G G T
G C T, = G C A
G T T, = G T A
C T T,= A T T
C A G, = C A T
A A T, = A A G
C A A ,= T A A -

две буквы из трёх не меняются. Меняется только одна буква - третья, или первая буквы( в случаях № 5,№ 9, №12 )

5 ШАГ-
выделение дополнительных 12 триплетов-

T G G, C T A, A C G, C C T,
T C C, G G T, G C A, G T A,
A T T, C A T, A A G, T A A

5 ШАГ-
добавление к 20 основным триплетам 12 дополнительных триплетов-

C C C, T G A, C T G, A C T,
C C G, A C C, G G A, G A G,
G C T, G G G, G T T, T C A,
G T C, A G T, C T T, T T T,
A A A, C A G, A A T, C A A,
А, А+
+ T G G, C T A, A C G, C C T,
T C C, G G T, G C A, G T A,
A T T, C A T, A A G, T A A

в сумме получается множество из 32 триплетов и 4 пар нуклеотидов ( А,А, С, С) -

C,С,
C C C, T G A, C T G, A C T,
C C G, A C C, G G A, G A G,
G C T, G G G, G T T, T C A,
G T C, A G T, C T T, T T T,
A A A, C A G, A A T, C A A,
T G G, C T A, A C G, C C T,
T C C, G G T, G C A, G T A,
A T T, C A T, A A G, T A A,
А, А..

Это стандартное множество триплетов.

Стандартное множество триплетов содержит 32 триплета +остаток из 4 пары нуклеотидов ( А, А, С, С)-
то есть 96 пар нуклеотидов + 4 пары нуклеотида.
итого - 100 пар нуклеотидов

2 ДЕЙСТВИЕ -
формирование посстандартного множества триплетов-

1 ШАГ-
стандартное множество триплетов берётся как исходное-

C,С,
C C C, T G A, C T G, A C T,
C C G, A C C, G G A, G A G,
G C T, G G G, G T T, T C A,
G T C, A G T, C T T, T T T,
A A A, C A G, A A T, C A A,
T G G, C T A, A C G, C C T,
T C C, G G T, G C A, G T A,
A T T, C A T, A A G, T A A,
А, А.

2 ШАГ-

выделение палиндромов-
C C C, G G G, T T T, A A A,
GAG,

3 ШАГ-
трансформация однобуквенных палиндромов на неоднобуквенные палиндромы. Путём замены одной буквы, по признаку комплиментарности, с сохранением 2 букв ) -
C C C= C G C
G G G = G C G
T T T = T A T
A A A = A T A
G A G = G T G

4 ШАГ-
выделение асимметричных пар-
T G A
A G T
C T G
G T C
A C T
T C A

5 ШАГ-
трансформация каждого элемента асимметричной пары в палиндром.
Путём замены одной буквы, по признаку комплиментарности, с сохранением 2 букв )-
T G A = A G A
A G T = T G T
C T G = C T C
G T C = G T G
A C T = A C A
T C A = T C T

6 ШАГ-
замена в стандартном множестве триплетов по порядку следования на палиндромы, и изменённые пары-
C G C, A G A, C T C, A C A,
C C G, A C C, G G A, G T G,
G C T, G C G, G T T, T C T,
G T G, T G T, C T T, T A T,
A T A, C A G, A A T, C A A,
T G G, C T A, A C G, C C T,
T C C, G G T, G C A, G T A,
A T T, C A T, A A G, T A A,

7 ШАГ-
деление множества на 2 части - фундаментальную и нефундаментальную-

1 ЧАСТЬ- ФУНДАМЕНТАЛЬНАЯ -
C G C, A G A, C T C, A C A,
C C G, A C C, G G A, G T G,
G C T, G C G, G T T, T C T,
G T G, T G T, C T T, T A T,
A T A, C A G, A A T, C A A,

2 ЧАСЬ - НЕ ФУНДАМЕНТАЛЬНАЯ -
T G G, C T A, A C G, C C T,
T C C, G G T, G C A, G T A,
A T T, C A T, A A G, T A A,

8 ШАГ-
замена непалиндромных элементов на новые элементы в 1 ЧАСТИ , путём изменения одной буквы-
C C G= C C A
A C C= A G C
G G A = G G C
G C T = G C C
G T T = G A T
C T T = T T C
C A G = G A C
A A T = A A C
C A A = C G A

9 ШАГ-
составление нового множества - с заменённными элементами. В результате получилась 1 ЧАСТЬ постстандартного множества триплетов--

C G C, A G A, C T C, A C A,
C C A, A G C, G G C, G T G,
G C C, G C G, G A T, T C T,
G T G, T G T, T T C, T A T,
A T A, G A C, A A C, C G A,

10 ШАГ-
замена элементов в нефундаментальной 2 части-

2 ЧАСТЬ -
T G G, C T A, A C G, C C T,
T C C, G G T, G C A, G T A,
A T T, C A T, A A G, T A A,
А, А.
замена-
T G G = A G G
C T A = A T G
A C G = A G G
C C T = T C G
T C C = T A C
G G T, = T G C
G C A = G A A
G T A = T A G
A T T =T T G
C A T = T T A
A A G =T A A,

11 ШАГ-
формирование 2 ЧАСТИ - нефундаментальной-

A G G, A T G, C G G, T C G,
T A C, T G C, C G T, G A A,
T T G, T A G, A G G, T T A.

12 ШАГ-
соединение 1 и 2 ЧАСТЕЙ-

C G C, A G A, C T C, A C A,
C C A, A G C, G G C, G T G,
G C C, G C G, G A T, T C T,
G T G, T G T, T T C, T A T,
A T A, G A C, A A C, C G A,
A G G, A T G, C G G, T C G,
T A C, T G C, C G T, G A A,
T T G, T A G, A G G, T T A.

13 ШАГ -
замена 2 пар нуклеотидов ( А, А на Т,Т, а также С, С на G,G) и прибавление их к соединению 1 и 2 частей-
G, G,
C G C, A G A, C T C, A C A,
C C A, A G C, G G C, G T G,
G C C, G C G, G A T, T C T,
G T G, T G T, T T C, T A T,
A T A, G A C, A A C, C G A,
A G G, A T G, C G G, T C G,
T A C, T G C, C G T, G A A,
T T G, T A G, A G G, T T A.
T ,T.

Данное множество является Постстандартным множеством триплетов.
Стандартное и постстандартное множества триплетов вместе имеют 64 триплета, а также дополнительно 8 пар нуклеотидов - C, C, A, A, G, G, T, T.
( смотрите примечание № 10 )
Стандартное множество триплетов состоит из 100 пар нуклеотидов. Обозначаем его символом "А".

3 ДЕЙСТВИЕ -
формирование стандартного множества пар нуклеотидов осуществляется на основе стандартного множества триплетов, представленных без пробелов ( то есть без знака запятой )

Стандартное множество пар нуклеотидов-

C С
C C C T G A C T G A C T
C C G A C C G G A, G A G
G C T G G G G T T T C A
G T C A G T C T T T T T
A A A C A G A A T C A A
T G G C T A A C G C C T
T C C G G T G C A G T A
A T T C A T A A G T A A
А А.

4 ОПЕРАЦИЯ - ОПРЕДЕЛЕНИЕ МАТЕМАТИЧЕСКОЙ ФОРМУЛЫ ДНК-

1 ДЕЙСТВИЕ -
Множество А, которое состоит из 32 триплетов+4 пары нуклеотидов ( всего 100 пар нуклеотидов) представляется как минимальный (базовый) элемент в математической формуле ДНК, то есть в качестве единицы.
Множество А является первичной структурой Математической Формулы ДНК.

2 ДЕЙСТВИЕ-
1 ШАГ-
множество А представляем как элемент множества из 19 элементов -.
А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А.

2 ШАГ -
утроение множества, состоящего из 19 элементов А (из 19 А) -.

1 уровень -
А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А.

2 уровень-
А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А.

3 уровень -
А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А.

3 ШАГ-
обобщение 3 уровней-

А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А.
А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А.
А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А.

Данное множество состоит из 57 множеств А.

4 ШАГ-
прибавление ноля
к множеству, состоящему из 57 множеств А прибавляется одно множество А, имеющее статус ноль(0)

А( 0),
А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А.
А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А.
А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А,А,А, А.

Данное множество состоит из 58 элементов ( 57 множеств А +1 множество А, имеющее статус ноль)

3 ДЕЙСТВИЕ-
нумерация элементов множества, состоящего из 57 множеств А и 1 множества А, имеющего статус ноль. Всего 58 элементов.

нумерация множества, состоящего из 57 множеств А, а также 1 множества А, имеющего статус ноля. В сумме 58 элементов- 58 множеств А
При этом каждый из 58 элементов, умножается на число, которое соответствует количеству электронов,в соответствующем ему атоме мономера.
В результате нумерации получается следующее множество-

8A,6А,1А,8А, 1А,1А,6А,1А,6А,1А,8А,1А,1А,6А,6А,1А,1А,8А,1А,15А,
8А,8А,
8А,15А,8А,8А,8А,15А,8А,8А,8А,
7А,8А,7А,1А,1А,7А,7А,8А,7А,1А,7А,1А,
1А,7А,7А,7А,8А,1А,7А,8А,7А,1А,7А,7А.7А,1А,7А

Обозначим , полученное множество символом "АА".
Множество состоит из 333 элементов, каждый из которых аналогичен множеству А., которое состоит из стандартного множества пар нуклеотидов.
Множество АА состоит из 333 элементов, каждый из которых состоит из
состоит из стандартного множества пар нуклеотидов.

Поэтому, множество АА состоит из 9 990 триплетов, или округлённо из 10 000 триплетов.

4 ДЕЙСТВИЕ -

1 ШАГ-
Множество АА представляем как элемент множества, состоящего из 19 множеств АА.
В результате такого представления получается следующее множество -
АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА.

2 ШАГ -
утроение множества, состоящего из 19 множеств АА. В результате этого утроения получается следующее трёхуровневое множество -

1 уровень-
АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА.

2 уровень-
АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА.

3 уровень-
АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА.

3 ШАГ-
Обобщение утроенного множества, состоящего из 3 множеств, каждое из которых состоит из 19 множеств АА.

АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА.

АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА.

АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА,АА,АА, АА.

Данное множество состоит из 57 множеств АА.

4 ШАГ-
Прибавление 1 множества АА, имеющего статус ноль. В результате получается множество из 58 множеств АА.

5 ШАГ-
нумерация множества, состоящего из 58 элементов, каждый из которых аналогичен множеству АА.При этом каждый из 58 элементов, умножается на число, которое соответствует количеству электронов,в соответствующем ему атоме мономера..
В результате нумерации получается следующее множество-

8AА,6АА,1АА,8АА, 1АА,1АА,6АА,1АА,6АА,1АА,8АА,1АА,1АА,6АА,6АА,1АА,1АА,8АА,1АА,
15АА,
8АА,8АА,
8АА,15АА,8АА,8АА,8АА,15АА,8АА,8АА,8АА,
7АА,8АА,7АА,1АА,1АА,7АА,7АА,8АА,7АА,1АА,7АА,1АА,
1АА,7АА,7АА,7АА,8АА,1АА,7АА,8АА,7АА,1АА,7АА,7АА.7АА,1АА,7АА

Данное множество обозначаем символом "ААА"
Множество ААА состоит из 333 множеств АА.
Всего в множестве ААА содержится 333 элемента, каждый из которых состоит из 333 элементов, каждый из которых состоит из
стандартного множества пар нуклеотидов.
Множество ААА состоит из 3 300 000 триплетов, или из 10 000 000 пар нуклеотидов.

5 ДЕЙСТВИЕ -

1 ШАГ-
Множество ААА представляем как минимальный элемент множества, состоящего из 19 множеств, аналогичных множеству ААА.
В результате такого представления получается следующее множество -
ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,
ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА.

2 ШАГ -
утроение множества, состоящего из 19 множеств ААА. В результате этого утроения получается следующее множество -
1 уровень-
ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,
ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА.

2 уровень-
ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,
ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА.

3 уровень-
ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,
ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА.

3 ШАГ-
Обобщение утроенного множества, состоящего из 3 множеств, каждое из которых состоит из 19 множеств ААА-

ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,
ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА.
ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,
ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА.
ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,
ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА,ААА,ААА, ААА.

в результате обобщения получается множество, состоящее из 57 множеств ААА.

4 ШАГ-
прибавлениек множеству, состоящему из 57 множеств ААА 1 множества ААА, имеющего статус ноль..
В результате прибавления множество состоит из 58 элементов, то есть из 58 множеств ААА.

5 ШАГ-
нумерация множества, состоящего из 58 множеств ААА.При этом каждый из 58 элементов, умножается на число, которое соответствует количеству электронов в соответствующем ему атоме мономера.
В результате нумерации получается следующее множество-

8AAA,6АAA,1АAA,8АAA, 1АAA,1АAA,6АAA,1АAA,6АAA,1АAA,8АAA,1АAA,1АAA,6АAA,6АAA,1АAA,1АAA,8АAA,1АAA,15АAA,8АAA,8АAA,
8АAA,15АAA,8АAA,8АAA,8АAA,15АAA,8АAA,8АAA,8АAA,7АAA,8АAA,7АAA,1АAA,1АAA,7АAA,7АAA,8АAA,7АAA,1АAA,7АAA,1АAA,
1АAA,7АAA,7АAA,7АAA,8АAA,1АAA,7АAA,8АAA,7АAA,1АAA,7АAA,7АAA.7АAA,1АAA,7АAA

Данное множество обозначим символом "АААА".
Множество состоит из 333 элементов, каждый из которых содержит
множество ААА.

Множество АААА состоит из 333 элементов, каждый из которых состоит из 333 элементов , состоящих из 333 элементов, каждый из которых состоит из стандартного множества пар нуклеотидов.

Множество АААА охватывает 3 300 000 000 пар нуклеотидов.
Множество АААА является обобщением Математической Формулы ДНК.

ВЫВОДЫ-

МАТЕМАТИЧЕСКАЯ ФОРМУЛА ДНК имеет 2 вида -

Математическая Формула ДНК( построенная по индукции - от частного к общему)-

8AAA,6АAA,1АAA,8АAA, 1АAA,1АAA,6АAA,1АAA,6АAA,1АAA,8АAA,1АAA,1АAA,6АAA,6АAA,1АAA,1АAA,8АAA,1АAA,15АAA,8АAA,8АAA,
8АAA,15АAA,8АAA,8АAA,8АAA,15АAA,8АAA,8АAA,8АAA,7АAA,8АAA,7АAA,1АAA,1АAA,7АAA,7АAA,8АAA,7АAA,1АAA,7АAA,1АAA,
1АAA,7АAA,7АAA,7АAA,8АAA,1АAA,7АAA,8АAA,7АAA,1АAA,7АAA,7АAA.7АAA,1АAA,7АAA

где
1А = стандартное множество триплетов. Стандартное множество триплетов имеет следующий вид -
C,С,
C C C, T G A, C T G, A C T,
C C G, A C C, G G A, G A G,
G C T, G G G, G T T, T C A,
G T C, A G T, C T T, T T T,
A A A, C A G, A A T, C A A,
T G G, C T A, A C G, C C T,
T C C, G G T, G C A, G T A,
A T T, C A T, A A G, T A A,
А, А

Математической формулы ДНК ( построенная по дедукции - от общего к частному) -

100X33Х333X333X333=3 300 000 000

где-
1)
100= стандартное множество пар нуклеотидов.
Стандартное множество пар нуклеотидов имеет следующий вид -

C С
C C C T G A C T G A C T
C C G A C C G G A, G A G
G C T G G G G T T T C A
G T C A G T C T T T T T
A A A C A G A A T C A A
T G G C T A A C G C C T
T C C G G T G C A G T A
A T T C A T A A G T A A
А А.

2)
333 = 8,6,1,8, 1,1,6,1,6,1,8,1,1,6,6,1,1,8,1,15,8,8,
8,15,8,8,8,15,8,8,8,7,8,7,1,1,7,7,8,7,1,7,1,
1,7,7,7,8,1,7,8,7,1,7,7.7,1,7 ( множество элементов, представляющих количество электронов в последовательности атомов мономера),

3)
3 300 000 000= 3 300 000 000 пар нуклеотидов,

С помощью Математической Формулы ДНК можно установить -

1) классификацию элементов ДНК -
а)стандартного множества триплетов, и стандартное множество пар нуклеотидов - первичная структура ,
б)множества, состоящих из 333 множеств, каждое из которых состоит из стандартного множества триплетов, или стандартного множества пар нуклеотидов - вторичная структура,
в) множества, состоящие из 333 множеств, которые состоят из 333 множеств, каждый элемент которых состоит из стандартного множества триплетов, или стандартного множества пар нуклеотидов - третичная структура.
г) множества, состоящие из 333 множеств, которые состоят из 333 множеств, которые состоят из 333 множеств, каждый элемент которых состоит из стандартного множества триплетов, или стандартного множества пар нуклеотидов

2) связи и субординация между элементами ДНК.

Установление связи и субординации, а также классификация элементов позволяет выявить системность двойной спирали ДНК

=================================

ПРИМЕЧАНИЯ -
ПРИМЕЧАНИЕ №1
В стандартном множестве пар нуклеотидов
счёт осуществляется по числу 3, то есть по утроенным парам нуклеотидов..
Набор утроенных пар нуклеотидов не меняется.
Однако, порядок следования утроенных пар нуклеотидов меняется на различных шагах построения двойной спирали ДНК..

ПРИМЕЧАНИЕ №2
Математические построения основываются на принципе абстрагирования и формализации. В процессе абстрагирования реальность представляется в идеальном виде. Следуя принципам абстрагирования и идеализации представляем мономер не как дезоксирибозу, фосфорную кислоту и одно из четырёх азотистых основания, но как дезоксирибозу, фосфорную кислоту, и все четыре азотистых основания вместе.
В сумме получается 333 электрон.

ПРИМЕЧАНИЕ № 3
А) количество электронов в дезоксирибозе равно 19,
Б) количество электронов в мономере равно 58 ( 57 основных и 1 неосновной элемент, имеющий статус ноля -смотрите Примечания № 5 и № 6 )..
57 основных электронов =19+19+19,
В) каждое из утраиваемых множеств на различных шагах построения математической модели ДНК имеет 19 элементов,
Г) построение математической модели ДНК, состоящей из 3 300 000 000 элементов основано на алгоритме 19.

ПРИМЕЧАНИЕ № 4
В качестве исходного геометрического обьекта в рамках математической модели ДНК принимается куб.
Последовательное деление куба на-
1) 333 части,
2) дальнейшее деление вновь образованных частей на 333 части (малых куба),
3) дальнейшее деление этих малых кубов на 333 части.
Каждая операция деления основана на алгоритме 19 -
размещение по 6 точек по высоте, длине, ширине=18 точек+1 точка в основании . В сумме размещение 19 точек, которые делят куб на 333 части( 333 малых куба), при предварительном вычитании 9 частей( 9 малых кубов),
4) деление самых малых кубов на 100 частей основано на алгоритме 19-
размещение по высоте и длине в каждом из малых кубов по 9 точек ( 18 точек)+1 точка в основании.В сумме 19 точек формируют 100 частей, которые представляют 100 пар нуклеотидов,

1А) число 3, которое также определяет многие связи и уровни в математической модели ДНК-
А)3 пары нуклеотидов образуют триплет (то есть пару строенных триплетов )
Б) 33 основных единицы стандартного множества пар нуклеотидов..
В) 333 электрона мономера.
Г) 3 300 000 000 пар нуклеотидов в ДНК.
Число 3 является минимальным непустым подмножеством множества, состоящего из 19 элементов( по Канторовской теории множеств для получения числового континуума необходимо деление отрезка на 1 шаге на 20 частей , то есть размещение 19 точек, при котором центральная точка и две ближайшие к центру точки по обе стороны дают число 3)

ПРИМЕЧАНИЕ №.5.
дезоксирибоза, рассматриваемая сама по себе, то есть вне связи с фосфорной кислотой имеет 19 элементов. Однако, при соединении с фосфорной кислотой происходит.утрата молекулы водорода -10H -элемента №19.Утрата молекулы воды ведёт к тому, что элемент №19 - обеспечивает непрерывность связи элемента №18 и элемента №20 )

ПРИМЕЧАНИЕ № 6
Расширение модели мономера

1 ШАГ--
множество элементов, представляющих количество электронов в последовательности атомов мономера-
8,6,1,8, 1,1,6,1,6,1,8,1,1,6,6,1,1,8,1,15,8,8,
8,15,8,8,8,15,8,8,8,7,8,7,1,1,7,7,8,7,1,7,1,
1,7,7,7,8,1,7,8,7,1,7,7.7,1,7
Обозначим это множество символом N.

2ШАГ-
множество N представим в качестве элемента множества, состоящего из 19 элементов-
N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N.

3ШАГ-
утроение множества, состоящего из 19 элементов-

1 уровень-

N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N

2 уровень-

N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N

3 уровень-

N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N

4 ШАГ-
прибавляем к 1 уровню 1 N, которая будет иметь статус ноль(0).

N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N

5 ШАГ-
проводим обобщение 3 уровней-
N
N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N
N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N
N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N, N

В результате сформировалось множество, состоящее из 58 элементов

6 ШАГ-
проводим нумерацию, то есть -
8,6,1,8, 1,1,6,1,6,1,8,1,1,6,6,1,1,8,1,15,8,8,
8,15,8,8,8,15,8,8,8,7,8,7,1,1,7,7,8,7,1,7,1,
1,7,7,7,8,1,7,8,7,1,7,7.7,1,7
При этом каждый элемент получает количественное определение ( число), которое соответствует количеству электронов, в соответствующем этому элементу атоме мономера.
.

8N,6N,1N,8N, 1N,1N,6N,1N,6N,1N,8N,1N,1N,6N,6N,1N,1N,8N,1N,15N,8N,8N,
8N,15N,8N,8N,8N,15N,8N,8N,8N,7N,8N,7N,1N,1N,7N,7N,8N,7N,1N,7N,1N,
1N,7N,7N,7N,8N,1N,7N,8N,7N,1N,7N,7N.7N,1N,7N

Данное множество состоит из 333 N.

ПРИМЕЧАНИЕ № 7
При соединении дезоксирибозы с фосфорной кислотой происходит отнятие молекулы воды от гидроксильной группы сахарного и фосфорного остатков Значит, утрачивается водород, то есть 1 электрон. Поэтому при соединении дезоксирибозы с фосфорными остатками у дезоксирибозы остаётся 71 электрон, а не 72 электрона. Значит дезоксирибоза, рассматриваемая как часть мономера ДНК будет иметь 71 электрон.

ПРИМЕЧАНИЕ № 8.
Во всех аминокислотах содержатся 2 реакционноспособные группы- аминогруппа и карбоксильная
Аминогруппа состоит из 1 атома азота и 2 атомов водорода. В сумме они составляют 9 электронов.

ПРИМЕЧАНИЕ № 9
В данной модели каждая пара ( спаренный ) нуклеотид двойной спирали ДНК представлен только одним элементом - одним нуклеотидом. Второй нуклеотид реально существующий , в данной формуле не обозначается.

ПРИМЕЧАНИЕ № 10.

Стандартное множество триплетов, то есть иножество А, которое состоит из 32 триплетов+ 4 пары нуклеотидов из А,А ,С,С на различных уровнях двойной спирали ( на каждом шаге построения Математической Формулы) -
1) не меняется состав стандартного множества триплетов, то есть набор триплетов остаётся неизменным,
2) порядок следования триплетов меняется

https://www.facebook.com/permalink.php? ... 7326128502


Вернуться к началу
 Профиль  
Ответить с цитатой  
Показать сообщения за:  Поле сортировки  
Начать новую тему Ответить на тему  [ 1 сообщение ] 

Часовой пояс: UTC + 4 часа


Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: нет зарегистрированных пользователей и гости: 1


Вы не можете начинать темы
Вы не можете отвечать на сообщения
Вы не можете редактировать свои сообщения
Вы не можете удалять свои сообщения
Вы не можете добавлять вложения

Найти:
Перейти:  
cron